?;鶊F(tuán)是許多活性天然產(chǎn)物的藥效基團(tuán),催化?;M裝的轉(zhuǎn)移酶因其寬泛的底物選擇性成為藥物研發(fā)中化合物結(jié)構(gòu)多樣性研究的重要工具酶,但目前對于其底物選擇性的分子機(jī)制研究報道較少。二十四元大環(huán)內(nèi)酯類抗生素Macrolactins(MLNs)有多種藥理學(xué)活性,其中帶有丙二?;揎椇顽牾;揎椀腗LNs對多種多重耐藥菌具有良好的抑制作用,然而其?;笮揎棛C(jī)制尚不清楚。
該研究采用體內(nèi)遺傳學(xué)、體外酶學(xué)、蛋白晶體學(xué)等手段,以海洋芽孢桿菌B-9987為研究對象,首次系統(tǒng)闡明了MLNs酰基化后修飾步驟,發(fā)現(xiàn)β-內(nèi)酰胺酶同源蛋白BmmI能夠特異性選擇帶有羧基末端的酰基供體,并對酰基供體和?;荏w顯示出較寬的底物選擇性。為了探究BmmI的底物選擇分子機(jī)制,作者解析了BmmI與琥珀酰基共價連接的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)一個特殊的“氧陰離子穴”類似結(jié)構(gòu)扮演了?;wgatekeeper的角色,通過設(shè)計(jì)“粗調(diào)”和“微調(diào)”方案對該“氧陰離子穴”結(jié)構(gòu)進(jìn)行了理性改造,成功拓寬了BmmI?;w選擇性。該研究還解析了BmmI與MLN A的復(fù)合物蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),揭示了酰基受體的結(jié)合方式,闡明了BmmI催化?;磻?yīng)的分子機(jī)制。該研究系統(tǒng)闡釋了?;D(zhuǎn)移酶底物選擇性的分子機(jī)制,為酶的理性設(shè)計(jì)與改造提供了理論指導(dǎo),也為創(chuàng)新藥物研發(fā)提供了有力工具。
BmmI特殊的“氧陰離子穴”類似結(jié)構(gòu)及其理性改造
中國海洋大學(xué)劉揚(yáng)博士、李花月副教授,中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所東升副研究員、馮銀鋼研究員、崔球研究員和北京大學(xué)云彩虹教授為論文共同作者,該研究工作得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目資助。李文利課題組長期致力于海洋微生物次級代謝產(chǎn)物合成生物學(xué)研究,在J. Am. Chem. Soc.、Nat. Commun.等發(fā)表SCI研究論文50余篇,受邀在Trends Biochem. Sci.(IF=16.889)上發(fā)表綜述“Next-Generation Drug Discovery to Combat Antimicrobial Resistance”,被推選榮獲Thieme Chemistry Journals Award 2020獎項(xiàng)。
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