該文首次報道了一種從放線菌C.acidiphila發(fā)現(xiàn)的新型二萜合成酶CaCS,并深入研究了它的酶產(chǎn)物化合物1–3。通過詳盡的同位素標記實驗,科研團隊確證了1–3的生物合成途徑,并得到了它們的絕對構型。另外,一個雙鍵被還原的底物類似物被合成出來并成功的運用在該酶表達,表達產(chǎn)物的結構得到確證并進一步佐證了前述生源合成途徑的正確。因為底物類似物有可能在酶中與天然底物有不同的構象,所以化合物4–6也通過同位素標記實驗確證了其絕對構型和環(huán)化機理。它們的結構證明,這些化合物在酶中并未出現(xiàn)化合物構型翻轉的其他情況?;衔?–6與一些已知的海洋天然產(chǎn)物非常相似,這些結構的探索對這些骨架的化學問題也有了更深入的理解。(圖1--圖4)。
圖1:經(jīng)酶CaCS孵育產(chǎn)物的總離子流圖
圖2:在二萜合成酶(CaCS)的作用下,GGPP形成新型二萜分子1–3的環(huán)化過程。
圖3:13C-NMR 譜圖, A) 1, B) 2, C) 3, and D) (1-13C)GGPP 與CaCS孵育的同位素標記實驗結果。圓圈代表13C標記。
圖4: 化合物1的C1到C11的1,3氫遷移機理探究。
上海藥物所和德國波恩大學聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生李耿為文章的第一作者,藥物所導師郭躍偉研究員和德國波恩大學的Dickschat教授為共同通訊作者。該工作得到國家自然科學基金重大項目、重點國際合作項目、科技部“重大新藥創(chuàng)制”重大專項、國家重點研發(fā)計劃和CAS-DAAD博士聯(lián)合培養(yǎng)獎學金項目的支持。
參考資料
[1] 中國科學院上海藥物研究所 ,上海藥物所郭躍偉課題組二萜生物合成研究取得最新進展
Angew. Chem. Int. Ed. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ange.202014180
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