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近日，《德國(guó)應(yīng)用化學(xué)》（Angewandte Chemie International Edition）在線發(fā)表了武漢大學(xué)藥學(xué)院孫宇輝教授課題組和德國(guó)波恩大學(xué)Jeroen S. Dickschat教授課題組在聚酮合酶（Polyketide synthase, PKS）生物合成領(lǐng)域最新研究進(jìn)展，揭示了PKS中A型脫水雙模塊結(jié)構(gòu)域共同催化形成Z型雙鍵的作用機(jī)制。武漢大學(xué)為第一完成單位，藥學(xué)院博士研究生羅明和和波恩大學(xué)許厚超為本論文共同第一作者，孫宇輝教授和德國(guó)波恩大學(xué)Jeroen S. Dickschat教授為共同通訊作者。此研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和微生物代謝國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放課題的支持。

肝臟是人體內(nèi)以代謝功能為主的一個(gè)重要器官。而生活中許多原因都容易導(dǎo)致肝損傷，現(xiàn)代快節(jié)奏的生活也加劇了肝損傷，肝損傷后期極易發(fā)展成為肝硬化及肝癌，嚴(yán)重威脅人類健康。然而，目前臨床抗肝損傷藥物較少，開(kāi)發(fā)新的抗肝損傷藥物成為治療肝損傷的需求迫切。

孫宇輝教授課題組前期在微生物活性天然產(chǎn)物的挖掘過(guò)程中，從武漢大學(xué)校園土壤中分離到的一株鏈霉菌（Streptomyces spectabilis CCTCC M2017417）中發(fā)現(xiàn)了一類具有抗耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA）活性的萘安莎類抗生素曲張鏈絲菌素（Streptovaricins），并對(duì)參與曲張鏈絲菌素的多個(gè)細(xì)胞色素P450酶編碼基因進(jìn)行了全面探索（ACS Chemical Biology, 2017, 12: 2589-2597），揭示了與其中亞甲基雙氧橋結(jié)構(gòu)相關(guān)的生物合成機(jī)制（Nature Communications, 2020, 11: 4501）。在對(duì)這一菌株活性次生代謝產(chǎn)物的進(jìn)一步挖掘過(guò)程中，重新分離獲得了媲美一線抗肝損傷臨床藥物水飛薊素的活性先導(dǎo)化合物Hangtaimycin，并糾正了其立體化學(xué)構(gòu)型。通過(guò)對(duì)Hangtaimycin的結(jié)構(gòu)及其生物合成基因簇生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)Hangtaimycin的碳骨架化學(xué)結(jié)構(gòu)與催化其生物合成的PKS結(jié)構(gòu)域（Domain）功能之間存在非經(jīng)典線性對(duì)應(yīng)，其中HtmA1中四個(gè)模塊（Module）僅負(fù)責(zé)催化兩輪碳鏈延伸。通過(guò)與Jeroen S. Dickschat教授課題組，以及藥學(xué)院沈坤副研究員、項(xiàng)瑾副教授團(tuán)隊(duì)合作，運(yùn)用體內(nèi)遺傳失活、底物化學(xué)合成及體外生化重建等方法，證明模塊1僅負(fù)責(zé)一個(gè)不飽和雙鍵單元的延伸，模塊2模塊3以非典型共線性脫水雙模塊的方式，共同催化第二個(gè)Z型雙鍵的形成。

在經(jīng)典的I型PKS催化聚酮碳鏈骨架生物合成過(guò)程中，PKS模塊和結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和功能與其所催化形成的相應(yīng)化學(xué)結(jié)構(gòu)之間存在著嚴(yán)格的線性對(duì)應(yīng)關(guān)系，即聚酮鏈合成的底物選擇、還原程度和產(chǎn)物的立體化學(xué)構(gòu)型都是由PKS上相應(yīng)模塊中的結(jié)構(gòu)域所決定，通過(guò)對(duì)酮基選擇性地還原和脫水，從而在終產(chǎn)物的相應(yīng)位置形成酮基、羥基、雙鍵等功能團(tuán)，同時(shí)還可決定產(chǎn)物手性中心的立體化學(xué)構(gòu)型。盡管之前在PKS中已發(fā)現(xiàn)脫水雙模塊之間可以合作的方式共同催化一個(gè)雙鍵的形成，但是本研究首次證實(shí)了這一脫水雙模塊的作用方式和機(jī)制。這一發(fā)現(xiàn)有助于進(jìn)一步拓展人們對(duì)PKS經(jīng)典的線性裝配模式的認(rèn)知，也為聚酮藥物的人工創(chuàng)新提供新的契機(jī)和靈感。

論文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202106250

參考資料：http://pharmacy.whu.edu.cn/info/1069/3208.htm