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北航常凌乾團(tuán)隊(duì)《PNAS》:納米細(xì)胞芯片,精準(zhǔn)篩選肺癌免疫治療獲益人群

來源:北京航空航天大學(xué)      2024-05-07
導(dǎo)讀:免疫療法是當(dāng)前最具臨床前景的腫瘤治療方式之一,曾獲2018年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。該療法采用PD-L1抑制劑等免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICI),重新激活癌癥患者體的免疫細(xì)胞,從而提高對(duì)腫瘤細(xì)胞的識(shí)別和清除能力。但在臨床中,僅有部分患者能從免疫治療中獲益。導(dǎo)致獲益率差的主要原因之一是,臨床常規(guī)組織活檢,受限于取樣位和檢測(cè)的精準(zhǔn)性,無法準(zhǔn)確評(píng)估腫瘤的異質(zhì)性。同時(shí),僅依靠單一免疫標(biāo)記物(如 PD-L1),無法準(zhǔn)確預(yù)測(cè)患者對(duì) ICI反饋。因此,如何精準(zhǔn)預(yù)測(cè)免疫治療的療效,成為了個(gè)性化精準(zhǔn)免疫治療面臨的首要問題。

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針對(duì)該臨床問題,北京航空航天大學(xué)常凌乾團(tuán)隊(duì)報(bào)道了一種新型納米醫(yī)療芯片,可以快速檢測(cè)肺癌循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)內(nèi)PD-L1基因表達(dá)、以及腫瘤細(xì)胞響應(yīng)免疫細(xì)胞的行為表型;進(jìn)一步對(duì)患者來源的CTCs進(jìn)行亞群劃分,依此預(yù)測(cè)肺癌患者對(duì)免疫療法的治療效果。與傳統(tǒng)組織活檢技術(shù)相比,臨床準(zhǔn)確率(AUC值)由57%顯著提高到90%以上。成果以“Genetic and phenotypic profiling of single living circulating tumor cells from patients with microfluidics”為題,發(fā)表在《PNAS》上。

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圖1. 循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)捕獲、原位培養(yǎng)和基因分析芯片系統(tǒng)NICHE,用于肺癌免疫治療的精準(zhǔn)預(yù)測(cè)與監(jiān)測(cè)。

該納米芯片采用磁場(chǎng)和細(xì)胞尺寸,高效去除(> 93%)血樣中的白細(xì)胞,并捕獲CTCs使其形成單細(xì)胞陣列(>95%)。為了實(shí)現(xiàn)活CTCs內(nèi)PD-L1基因的準(zhǔn)確檢測(cè),研究者們?cè)O(shè)計(jì)了一種具有四面體結(jié)構(gòu)的探針,實(shí)現(xiàn)對(duì)活細(xì)胞內(nèi)PD-L1基因、內(nèi)參GAPDH基因、以及CTCs鑒定基因的同時(shí)檢測(cè)。芯片采用實(shí)驗(yàn)室標(biāo)簽遞送技術(shù)——納米電穿孔,在2秒內(nèi)將探針遞送至95%細(xì)胞內(nèi),且保持良好的細(xì)胞安全性(90%),遞送性能顯著優(yōu)于與其他常規(guī)方法(2)。

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圖2. 在單個(gè)活細(xì)胞水平CTCs內(nèi)PD-L1 mRNA的精準(zhǔn)量化。

完成基因檢測(cè)的CTCs,保持了良好的活性。通過與免疫T細(xì)胞的共培養(yǎng),研究者們發(fā)現(xiàn),部分腫瘤細(xì)胞在免疫抑制劑存在時(shí),細(xì)胞形態(tài)發(fā)生了明顯的變長(zhǎng),且細(xì)胞增殖行為被顯著抑制3)。根據(jù)腫瘤細(xì)胞PD-L1的表達(dá)情況,研究者們劃分出了PD-L1高表達(dá)與低表達(dá)的閾值;另外,根據(jù)腫瘤細(xì)胞與免疫細(xì)胞共培養(yǎng)的結(jié)果,研究者們劃分出了腫瘤細(xì)胞形態(tài)發(fā)生變化的閾值。綜合CTCsPD-L1高表達(dá)(PD-L1high)且表型發(fā)生變化(PA+)的占比,該研究定義了一種新的指標(biāo),“NICHE指數(shù)”,用于預(yù)測(cè)癌癥患者響應(yīng)免疫療法的療效。

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圖3. CTCs與免疫細(xì)胞共培養(yǎng)下發(fā)生形態(tài)改變。

為了評(píng)估NICHE在臨床上預(yù)測(cè)免疫療效的性能,收集了80 名非小細(xì)胞肺癌患者的外周血,通過在NICHE平臺(tái)上的檢測(cè),證明了該平臺(tái)捕獲 CTCs 并鑒定其基因和行為表型的能力(4。NICHE指數(shù)在預(yù)測(cè)臨床預(yù)后方面,表現(xiàn)出高準(zhǔn)確性(AUC=0.906,明顯高于目前臨床上基于腫瘤組織中PD-L1表達(dá)細(xì)胞占比的標(biāo)準(zhǔn)參考方法(AUC=0.578)。目前,該團(tuán)隊(duì)正在聯(lián)合北大腫瘤醫(yī)院吳楠主任,制定一項(xiàng)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),用于肺癌免疫治療獲益人群篩選,以達(dá)到肺癌個(gè)性化醫(yī)療,有望降低臨床癌癥醫(yī)療負(fù)擔(dān)。

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圖4. 采用NICHE系統(tǒng)對(duì)肺癌血樣中的CTCs進(jìn)行捕獲與分析,并實(shí)現(xiàn)了患者免疫治療的精準(zhǔn)預(yù)測(cè)。

該論文的其他通訊作者包括北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院吳楠教授、格拉斯哥大學(xué)Jonathan M. Cooper 教授、北京機(jī)械設(shè)備研究所楊明珠研究員。第一作者為北航醫(yī)學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院董再再(助理教授)、北航生物與醫(yī)學(xué)工程學(xué)院汪于森碩士、北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院劉冰博士、上海市感染和免疫疾病科技創(chuàng)新中心徐高連教授。

文章鏈接:https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2315168121


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