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Nature:“有破有立”實(shí)現(xiàn)嘧啶的多樣性轉(zhuǎn)化

來(lái)源:化學(xué)加原創(chuàng)      2024-05-08
導(dǎo)讀:近日,美國(guó)科羅拉多州立大學(xué)(Colorado State University)Robert S. Paton和Andrew McNally課題組發(fā)展了一種將嘧啶轉(zhuǎn)化為其它氮雜芳烴的新策略。通過(guò)將嘧啶轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的N-芳基嘧啶鹽,其經(jīng)歷裂解形成三碳單位的亞胺烯胺砌塊,并應(yīng)用于各種雜環(huán)形成反應(yīng)中。這種連續(xù)的“有破有立”即解構(gòu)-重建策略使嘧啶骨架更多樣化,并能夠獲得其它的唑類(lèi)雜環(huán)。利用此方法可以在復(fù)雜分子上形成雜環(huán),從而產(chǎn)生用其它方法難以獲得的類(lèi)似物。相關(guān)成果發(fā)表在Nature上,文章鏈接DOI:10.1038/s41586-024-07474-1。

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(圖片來(lái)源:Nature


正文

在藥物的構(gòu)效關(guān)系(SAR)研究中,修飾候選化合物的結(jié)構(gòu)可以?xún)?yōu)化其在藥物和農(nóng)用化學(xué)品開(kāi)發(fā)中的理化性質(zhì)。然而,到目前為止,只有少數(shù)幾種合成策略適用于小分子候選物中經(jīng)常出現(xiàn)的氮雜芳烴的修飾。最近,美國(guó)科羅拉多州立大學(xué)Robert S. PatonAndrew McNally課題組發(fā)展了將嘧啶轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的N-芳基嘧啶鹽,并經(jīng)歷連續(xù)的解構(gòu)-重建策略實(shí)現(xiàn)了一系列取代嘧啶和唑類(lèi)雜環(huán)的合成(Fig. 1)。化學(xué)加——科學(xué)家創(chuàng)業(yè)合伙人,歡迎下載化學(xué)加APP關(guān)注。

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(圖片來(lái)源:Nature

Fig. 2展示了通過(guò)開(kāi)環(huán)-關(guān)環(huán)反應(yīng)過(guò)程合成嘧啶鹽,并通過(guò)解構(gòu)-重建方法將嘧啶轉(zhuǎn)化為2-取代嘧啶和1,2-唑類(lèi)的例子。在合成嘧啶鹽的過(guò)程中,一系列不同取代的嘧啶,包括4-單取代嘧啶、5-單取代嘧啶、4,5-二取代嘧啶均可兼容此轉(zhuǎn)化(3b-3g, 58-92%)。遺憾的是,喹唑啉類(lèi)化合物在成鹽過(guò)程中并不成功。反應(yīng)中其它的不能實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的底物包括4-鹵嘧啶,4-甲基嘧啶和2-取代的嘧啶。在這些情況中或者產(chǎn)率較低或者存在競(jìng)爭(zhēng)性副反應(yīng)。在解構(gòu)-重建過(guò)程中,所形成的的亞胺烯胺中間體可以分別與脲(5b, 25%)、硫脲(5c, 93%)、三氟甲基乙脒(5f, 75%)等反應(yīng)得到相應(yīng)的2-取代的嘧啶。此外,一系列復(fù)雜生物活性分子片段同樣可以兼容,以38-75%的產(chǎn)率得到相應(yīng)的2-取代的嘧啶。值得注意的是,利用此策略還可以將嘧啶轉(zhuǎn)化為唑類(lèi)化合物6b-6g40-90%)。

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(圖片來(lái)源:Nature

為了進(jìn)一步證明此轉(zhuǎn)化的實(shí)用性,作者嘗試?yán)么私鈽?gòu)-重建策略實(shí)現(xiàn)生物活性分子的修飾(Fig. 3)。首先,作者利用一鍋法策略將殺菌劑fenarimol (1b)轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的氨基、環(huán)丙基和苯基衍生物5q-5s28-38%)(Fig. 3a)。隨后,為了探索更具挑戰(zhàn)性的含嘧啶結(jié)構(gòu)的兼容性,作者選擇一種治療黑色素瘤的小分子藥物dabrafenib作為底物進(jìn)行研究(Fig. 3b)。當(dāng)利用一鍋法策略實(shí)現(xiàn)嘧啶鹽的原位形成后,作者分別使用胍、環(huán)丙基乙脒和三氟甲基乙脒與其反應(yīng)可以分別得到2號(hào)位氨基化、環(huán)丙基化和三氟甲基化的產(chǎn)物5t (64%), 5u (61%), 5v (23%)。此外,將亞胺烯胺中間體4b進(jìn)行斷裂并分別經(jīng)歷與肼和羥胺的環(huán)化可以以47-86%的產(chǎn)率得到相應(yīng)的唑類(lèi)產(chǎn)物6h-6j。值得注意的是,利用吡啶鹽3h的斷裂以及NCS氯化和與環(huán)丙基乙脒的環(huán)化,可以以52%的產(chǎn)率得到雙官能團(tuán)化嘧啶產(chǎn)物5w

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接下來(lái),作者嘗試?yán)盟l(fā)展的解構(gòu)-重建方法將嘧啶轉(zhuǎn)化為吡啶(Fig. 4)。在嘧啶鹽形成后,使用商業(yè)可得的乙?;谆柙?/span>NH4OAcAcOH存在下9oC反應(yīng)可以以38-72%的產(chǎn)率得到相應(yīng)的吡啶產(chǎn)物7a-7d。利用此轉(zhuǎn)化可以實(shí)現(xiàn)形式上的C原子取代嘧啶N原子,這在SAR研究中起著至關(guān)重要的作用。此外,Fig. 4b展示了利用不同的親核試劑實(shí)現(xiàn)了在C5C2位引入取代基,以61-72%的產(chǎn)率得到相應(yīng)的C5C2位取代的吡啶產(chǎn)物7e-7h

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最后,作者通過(guò)計(jì)算對(duì)嘧啶的開(kāi)環(huán)機(jī)理進(jìn)行了研究(Fig. 5)。Fig. 5a展示了1aTf2O和苯胺反應(yīng)的計(jì)算勢(shì)能面。1aTf2O之間的反應(yīng)是放熱的(-4.3 kcal mol-1),并通過(guò)TS-Act (ΔG? 12.6 kcal mol-1)一步進(jìn)行。苯胺隨后與NTf-嘧啶離子加成,且在C6 (ΔG? 15.1 kcal mol-1,通過(guò)TS-Add-C6)的親核進(jìn)攻要優(yōu)于C2 (ΔG? 15.9 kcal mol-1,通過(guò)TS-Add-C2),因此在-78 oC時(shí)的動(dòng)力學(xué)選擇性為8:1。這些過(guò)渡結(jié)構(gòu)(TS)的能量反映了電子Fukui (f +)指數(shù),表明C6C2 (0.15 vs 0.10)更具親電性。雖然C6-加合物需要吸收8.9 kcal/mol熱量來(lái)形成,但銨類(lèi)物種的脫質(zhì)子反應(yīng)是一個(gè)無(wú)需活化能的反應(yīng)過(guò)程,從而產(chǎn)生穩(wěn)定的中間體Int-I (ΔG -20.7 kcal mol-1),這表明堿驅(qū)動(dòng)了這一過(guò)程的發(fā)生。接下來(lái),Int-I經(jīng)歷開(kāi)環(huán)(ΔG? 10.7 kcal mol-1通過(guò)TS-II)形成aza-Zincke亞胺中間體Int-II。緊接著,Int-II通過(guò)互變異構(gòu)異構(gòu)化為Int-III,且在TS-IV (ΔG? 18.1 kcal mol-1,相對(duì)于Int-II)閉環(huán)之前以二氫嘧啶的形式形成Int-IV衍生物(ΔG -4.6 kcal mol-1)。由于關(guān)環(huán)過(guò)程需要最大的反應(yīng)能壘,因此TS-IV的形成為決速步驟。最后,與生成的-NHTf陰離子產(chǎn)生一個(gè)穩(wěn)定的離子對(duì)(Int-V),并通過(guò)隨后的陰離子復(fù)分解得到產(chǎn)物3a(總體ΔG? -34.5 kcal mol-1)。此外,作者通過(guò)計(jì)算得出嘧啶取代基的大小和電子性質(zhì)會(huì)顯著影響產(chǎn)物形成的能壘(Fig. 5b)。

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(圖片來(lái)源:Nature


總結(jié)


Robert S. PatonAndrew McNally課題組通過(guò)將嘧啶轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的N-芳基嘧啶鹽,裂解形成三碳單位的亞胺烯胺砌塊,并通過(guò)解構(gòu)-重建策略實(shí)現(xiàn)了嘧啶骨架的多樣性轉(zhuǎn)化,發(fā)展了一種將嘧啶轉(zhuǎn)化為各其它氮雜芳烴的新策略。此外,此策略還可以將嘧啶轉(zhuǎn)化為其它方法難以獲得的唑類(lèi)雜環(huán)。此解構(gòu)-重建反應(yīng)的發(fā)展為其它雜環(huán)的構(gòu)建提供了新的思路

文獻(xiàn)詳情:

A deconstruction-reconstruction strategy for pyrimidine diversification.

Benjamin J. H. Uhlenbruck, Celena M. Josephitis, Louis de Lescure, Robert S. Paton*, Andrew McNally*

Nature, 2024

https://doi.org/10.1038/s41586-024-07474-1.

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