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上海交大商明課題組JACS:首例配體驅(qū)動(dòng)的銅催化核苷類ProTide前藥的不對稱合成

來源:上海交通大學(xué)      2024-11-08
導(dǎo)讀:近日,上海交通大學(xué)變革性分子前沿中心的商明課題組實(shí)現(xiàn)了首例配體驅(qū)動(dòng)的廉價(jià)金屬銅催化核苷類ProTide前藥的不對稱合成,相關(guān)研究成果在Journal of the American Chemical Society上發(fā)表。? ??



正文

核苷類藥物在抗病毒、抗腫瘤藥物中占有相當(dāng)比重,其在酶催化下可形成核苷三磷酸靶向并抑制DNA聚合酶或RNA逆轉(zhuǎn)錄酶活性,從而發(fā)揮治療作用。由于磷酸基團(tuán)極性大難以通過細(xì)胞膜,McGuigan等人發(fā)明了核苷前藥(ProTide)策略。該技術(shù)通過將核苷磷酸根負(fù)離子掩蔽,從而更好地發(fā)揮生物活性。目前,前藥策略已經(jīng)被廣泛用于藥物的合成,已孕育出上市藥物包括索非布韋、瑞德西韋、丙酚替諾福韋和臨床候選藥物Adafosbuvir、Uprifosbuvir、INX-08189等(圖1a)。
研究發(fā)現(xiàn),ProTide前藥分子中磷的絕對構(gòu)型會改變代謝活化效率,極大影響藥效發(fā)揮。因此立體選擇性構(gòu)建磷手性中心,是核苷類藥物合成中的一個(gè)關(guān)鍵技術(shù)瓶頸。不對稱催化是構(gòu)建磷手性中心一種行之有效的方法。但是,截至目前,僅少數(shù)研究團(tuán)隊(duì)利用手性小分子催化劑,實(shí)現(xiàn)了為數(shù)不多的(RRP)和(SSP)-ProTides的催化不對稱合成(圖1b),從磷酰氯出發(fā)同時(shí)實(shí)現(xiàn)(RSP)和(SRP)-ProTides的催化不對稱合成還未有報(bào)道。近日,上海交通大學(xué)變革性分子前沿中心的商明課題組實(shí)現(xiàn)了首例配體驅(qū)動(dòng)的廉價(jià)金屬銅催化核苷類ProTide前藥的不對稱合成(圖1c)。    
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圖1
反應(yīng)具有以下三個(gè)挑戰(zhàn):第一,金屬催化立體選擇性構(gòu)建P-O鍵報(bào)道較少;第二,氨基磷酰氯底物具有獨(dú)特的配位模式、多個(gè)螯合位點(diǎn)和擁擠的三維空間;第三,配體要求嚴(yán)格,不僅要能提高反應(yīng)效率又要能控制手性。
鑒于過渡金屬催化的多種優(yōu)勢,作者使用市售可得的核苷2a與磷酰氯1a作為模板底物進(jìn)行反應(yīng)制備ProTide產(chǎn)物3,經(jīng)過一系列條件優(yōu)化(圖2),作者以97:3 d.r.和82%的收率得到目標(biāo)產(chǎn)物。反應(yīng)成功的關(guān)鍵在于使用剛性較強(qiáng)的手性環(huán)己二胺配體,輔以長鏈烷基邊臂效應(yīng),極大地改善了反應(yīng)結(jié)果。值得一提的是,降低催化劑負(fù)載至5mol%幾乎不會影響反應(yīng)結(jié)果。    
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圖2
在獲得最佳條件后,作者對底物范圍進(jìn)行了考察。首先考察了磷酰氯范圍,如圖3所示,各種L-丙氨酸磷酰胺都具有良好的耐受性(4-8, 68-90%, 95:5-98:2 d.r.),此外,L-苯丙氨酸、L-亮氨酸、L-異亮氨酸、L-叔亮氨酸、L-纈氨酸和L-苯甘氨酸等也能很好地適應(yīng)反應(yīng)條件(9-15、47-70%、95:5-97:3 d.r.),同樣地,未保護(hù)的L-色氨酸磷酰胺也能順利進(jìn)行(16,62%,93:7 d.r.);該催化模式對多種芳氧基底物表現(xiàn)依然十分出色,包括4-OMe、4-F、4-Br、3-Br和萘基(17-21),大大促進(jìn)芳氧基磷酰胺前藥構(gòu)效關(guān)系(SAR)研究。雖然2-Br磷酰胺(22)空間位阻大反應(yīng)活性低,但是烷氧基取代磷酰胺卻能以良好的收率和立體選擇性順利得到23。    
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圖3
接著,作者考察了核苷底物的適用范圍。如圖4所示,各種含有天然堿基和非天然堿基的核苷都具有強(qiáng)的反應(yīng)活性和高的立體選擇性(24-31, 40-92%, 95:5-99:1 d.r.),所開發(fā)的催化體系對含有敏感官能團(tuán)如丙酮叉、酰亞胺、未保護(hù)的胺、酰胺和親核性雜環(huán)底物都有很好的耐受性,包括抗HIV藥物疊氮胸苷(32)在內(nèi)的脫氧核苷底物也能高效轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的ProTide前藥(32-37,41-94%,94:6-97:3 d.r.)。X-射線單晶衍射確定了化合物34磷中心手性的絕對構(gòu)型是R構(gòu)型,鑒于嗎啉寡核苷酸(PMOs)在治療中的重要意義,作者進(jìn)一步合成了嗎啉類前藥,獲得了高達(dá)80%的產(chǎn)率和97:3 d.r.,將配體調(diào)整為L14,作者成功地將該方法應(yīng)用于一系列無保護(hù)的脫氧核苷底物,并有著優(yōu)異的5’:3’選擇性及立體選擇性。    
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圖4
隨后,作者成功地將反應(yīng)應(yīng)用到臨床抗腫瘤藥物NUC-3373、NUC-7738和抗病毒藥物司他夫定ProTide的合成中(圖5a),說明此反應(yīng)在ProTide前藥研發(fā)領(lǐng)域具有較大潛力;最后,作者研究了反應(yīng)機(jī)理,控制性實(shí)驗(yàn)表明,催化劑和配體兩者缺一不可(圖5b);調(diào)整配體的構(gòu)型,可同時(shí)得到(RSP)和(SRP)兩種構(gòu)型產(chǎn)物(圖5c);單晶衍射(圖5d)和HRMS(圖5f)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步確定了反應(yīng)過程中手性金屬絡(luò)合物的產(chǎn)生,驗(yàn)證了金屬催化的反應(yīng)機(jī)制。    
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圖5

總結(jié)

商明課題組報(bào)道了首例銅催化核苷類ProTide前藥的不對稱合成,發(fā)展了一種長鏈烷基取代的手性環(huán)己二胺配體,提高了反應(yīng)的效率和立體選擇性,該方法具有反應(yīng)條件溫和、操作簡單、適用范圍廣等優(yōu)點(diǎn)。作者通過將其應(yīng)用于臨床ProTide前藥的制備,證明了方法的實(shí)際效用,大大地推進(jìn)了ProTide前藥領(lǐng)域的發(fā)展。

招聘博士后和博士研究生    

商明課題組隸屬于上海交通大學(xué)變革性分子前沿科學(xué)中心,主要研究方向包括1.核苷酸高效合成方法開發(fā),手性核酸合成;2.非天然核苷酸模塊化合成方法開發(fā);3.核酸藥物開發(fā)。

因工作需要,擬招聘核酸化學(xué)/有機(jī)合成方向的博士后1-2名,待遇從優(yōu),年薪40萬起(無任何附加條件),歡迎具有相關(guān)研究經(jīng)歷并有志于從事核酸合成化學(xué)研究的青年才俊加盟。

另外,課題組同時(shí)招收2025年入學(xué)申請考核制博士生,歡迎對本課題組研究方向感興趣的同學(xué)聯(lián)系申請。

請有意申請者將個(gè)人簡歷(包含學(xué)習(xí)經(jīng)歷、工作經(jīng)歷、發(fā)表論文等內(nèi)容)發(fā)送至shangsjtu@sjtu.edu.cn。郵件標(biāo)題注明:應(yīng)聘崗位+本人姓名。申請截止時(shí)間2025年4月。

文獻(xiàn)詳情:

Ligand-Enabled Cu-Catalyzed Stereoselective Synthesis of P-Stereogenic ProTides
Shuai-Shuai Fang, XiangJun Hu, Ming-Hong Li, Shuang Qi, Tian Xie, Jia-Bao Wang, Hong-Qing Yao, Jian Zhang, Jun-Hua Zhang, Lijuan Zhu, and Ming Shang*
J. Am. Chem. Soc.2024,
https://doi.org/10.1021/jacs.4c12920

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